Automatisation de la coloration sur chaque banc pour une imagerie tissulaire meilleure et plus reproductible

Parhelia Omni-Stainer™ automatise les protocoles de biologie spatiale tout en réduisant les coûts de réactifs

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Le microenvironnement tumoral est un assemblage complexe de cellules cancéreuses, de cellules immunitaires, de cellules stromales et de composants de la matrice extracellulaire. Les interactions entre ces composants peuvent avoir un impact significatif sur la croissance tumorale et la réponse au traitement. Une certaine percée dans notre capacité à cartographier les microenvironnements tumoraux est venue avec l'avènement de l'ère de la biologie spatiale, où diverses techniques d'imagerie hautement multiplexées sont maintenant utilisées pour cartographier des dizaines de types de cellules in situ et des algorithmes informatiques sophistiqués sont utilisés pour modéliser quantitativement leurs relations dans la tumeur. contexte. Ces protocoles en plusieurs étapes sont très coûteux, soumis à de sévères limitations de débit d'échantillons, sujets à des variations de dosage et sont difficiles à adopter et à standardiser dans plusieurs laboratoires.

La vision de Parhelia est d'inaugurer une nouvelle ère de biologie reproductible dans laquelle la conformité, la reproductibilité et la robustesse de la recherche sont obtenues par la mise en œuvre d'une automatisation responsable au niveau d'un banc individuel. Dans cette vision, les protocoles seront partagés entre les laboratoires non pas par le biais d'une formation individuelle et d'une ingénierie inverse minutieuse par essais et erreurs, mais plutôt en partageant des scripts d'automatisation open source téléchargeables qui peuvent être déployés en appuyant simplement sur un bouton. Forcer les chercheurs à traduire la connaissance souvent implicite des moindres détails de protocoles complexes en commandes robotiques exactes et explicites permettra une diffusion rapide, une adoption facile, une version et une validation indépendante des nouveaux protocoles par la communauté de pairs.

Pour concrétiser cet avenir et relever les défis croissants de la recherche en biologie spatiale, Parhelia Biosciences a créé Omni-Stainer™, une station de travail révolutionnaire pour la coloration des tissus capable de déployer en toute transparence une pléthore d'analyses spatiales. Contrairement aux colorants automatiques d'histologie encombrants du passé, Parhelia Omni-Stainer™ est un appareil de paillasse compact dont le prix est intentionnellement bien inférieur aux limites budgétaires CapEx des laboratoires de recherche de taille moyenne (< 15 000 $).

Parhelia Omni-Stainer est un instrument modulaire construit sur un châssis d'un manipulateur de liquide open source au format SBS. Les modules sont conçus pour s'adapter à divers formats de coloration des tissus, y compris des échantillons réguliers montés sur lame ainsi que des échantillons plus exotiques montés sur lamelle qui sont de plus en plus utilisés dans les tests spatiaux tels que CODEX ou smRNA-FISH.

Chaque module héberge jusqu'à 12 échantillons en parallèle et l'Omni-Stainer peut être équipé de jusqu'à 10 modules de ce type, permettant un débit maximal de 120 échantillons par cycle. Les modules Omni-Stainer peuvent être équipés de blocs Peltier contrôlés par programmation, permettant un contrôle précis de la température dans la plage 0-99C. Cela permet de déployer des tests à température contrôlée sur Parhelia Omni-Stainer, y compris les protocoles ISH, la ligature et l'amplification de l'ADN, les tests cycliques IF et TSA tels que Opal.

Une coloration efficace et uniforme des échantillons est obtenue via un échange d'espace capillaire, qui est la caractéristique clé d'Omni-Stainer. Les échantillons sont incubés dans une fine couche capillaire de liquide de 60 µm, ce qui réduit considérablement l'utilisation de réactifs coûteux tels que les conjugués ADN-anticorps ou les sondes FISH.

La flexibilité inégalée de Parhelia Omni-Stainer permet la création de protocoles complexes arbitraires via une simple API Python. De plus, Parhelia offre à ses utilisateurs un accès à StainWorks, une application Web puissante qui contient un référentiel partagé de protocoles validés et permet aux utilisateurs de modifier et d'exécuter ces protocoles sans avoir à toucher à aucun code. Actuellement, StainWorks contient des protocoles validés pour IF, IHC, CODEX (PhenoCycler), IMC, Opal et RNAScope, et la liste ne cesse de s'allonger.

Parhelia Omni-Stainer a déjà été déployé dans des instituts de recherche de premier plan, notamment Stanford, Harvard, Broad, MD Anderson, Mayo Clinic, WUSTL, ainsi que dans la R&D pharmaceutique, notamment Novartis et Genentech.

En résumé, Parhelia Omni-Stainer est un outil puissant pour les chercheurs en biologie spatiale, les libérant des ornières des cycles répétitifs de coloration des tissus, réduisant l'utilisation coûteuse de réactifs et offrant une qualité et une reproductibilité inégalées de la coloration des tissus d'une simple pression sur un bouton.

Pour en savoir plus, rendez-vous sur www.parheliabio.com